银行间市场缺乏有效的政策及政策合力的扶持。目前，对于资本市场来说，中国货币市场的发展明显受到了忽视，资本市场超前于货币市场而得到了快速的发展，货币市场的发展滞后已越来越制约宏观金融调控效率的提高，从而间接影响到国民经济的协调发展。银行间市场组建后，尽管各部门对银行间市场的发展都给予了高度的关注，但在扶持和推动银行间市场的繁荣和发展上，却普遍缺乏有效、连续和实质性的政策及其政策合力的扶持。正是由于许多部门在制定政策时只注重了银行间市场的债券发行和财政融资功能，导致商业银行通过市场进行流通性管理和市场经济条件下宏观金融政策调控高效传导的政策功能减弱。主要表现在几个方面：

  第一，设计的金融工具品种过少。例如，1998年财政发债任务全部由商业银行承担，当年发行的6447亿元国债(含定向工商银行、农业银行、中国银行、建设银行的2700亿元国债)均为三至五年以上的中长期国债;1999年面向金融机构发行的国债也基本为中长期国债，缺少作为流通性工具的一年期以内的短期国债。由于商业银行持有的国债结构的不合理，交易主体的相对单一性及其投资动机的趋同性，使国债在市场上表现为流动性明显不足。

  第二，发行对象过于单一。由于面向银行间市场发行的记账式国债其发行对象是金融机构，这些金融机构的业务范围基本相同。处于同样的外界环境内，业务需求往往会表现出趋同性，在一定程度上影响了市场的活跃。

  第三，银行间债券市场是金融机构间的批发市场，主要进行机构间的批发交易。目前，商业银行尚不能通过自己的营业网点自由进行债券分销和买卖，与批发市场相对的债券柜台零售市场还未建立起来，众多的机构投资者和个人投资者无法通过银行进行债券交易，银行的俊券交易对手存在缺位，这些都制约了银行债券业务的开展。

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