科创板在上市制度上实现了重大突破，其核心亮点之一便是允许存在特殊股权结构的企业上市。这主要包含两大类：第一类是存在表决权差异安排的企业，也就是俗称的“同股不同权”或“AB股”架构。这类企业的核心特征是，部分股份拥有比普通股份更多的表决权。为确保其与普通股股东之间的权利平衡，规则对此有严格的约束，例如规定每一特别表决权股份的表决权数量不得超过普通股份的10倍，且该安排需在公司上市前设置并稳定运行。相应的，这类公司在上市时需满足更高的市值和财务要求，例如预计市值不低于100亿元，或不低于50亿元且最近一年营收不低于5亿元。
第二类是红筹企业。红筹企业通常指主要业务和运营在境内，但注册在境外并在境外上市的公司。科创板为这类企业的回归或直接上市提供了通道，其上市条件和信息披露等需符合相关试点规定。