上市公司发行的存托凭证与普通A股股票在股东权利行使规则上的核心区别在于：普通A股股东可以直接行使股东权利，而存托凭证持有人必须通过“存托机构”代为行使权利，属于间接行权。

具体而言，两者的差异体现在以下几个方面：

1. 股东身份与名册登记

普通A股：投资者购买股票后，会直接登记在上市公司的股东名册上，具备在册股东身份。
存托凭证：投资者持有的只是代表境外基础证券权益的凭证，其名字不会出现在境外上市公司的股东名册中。真实的境外基础证券由存托人（如银行）持有，投资者仅出现在存托凭证持有人名册中。

2. 表决权与投票意愿征集

普通A股：股东可以亲自出席或委托代理人出席股东大会，直接对议案进行投票表决。
存托凭证：存托凭证持有人不能以股东身份直接行使表决权。在召开股东大会前，存托机构会向持有人征求投票意愿，随后存托人会根据汇总的持有人意愿指示，代表持有人对基础普通股进行投票。如果持有人未参与意愿征求或未作出指示，其对应的股份将视为未出席股东会。

3. 资产收益权（分红派息）

普通A股：上市公司直接将现金红利或股票红利发放到股东的账户中。
存托凭证：分红派息由境外的上市公司发放给存托人，再由存托人（或托管机构）按照协议约定转换并派发给境内的存托凭证持有人。这个过程可能涉及换汇、清算等程序，导致境内持有人取得分红的时间较境外有所延迟，且可能因汇率波动产生金额差异。

4. 知情权与诉讼权

普通A股：股东直接享有查阅公司资料的权利，并在权益受损时可直接依据境内法律提起诉讼。
存托凭证：持有人依赖于存托机构和公司的公告来获取信息。若发生纠纷，虽然可以依据境内《证券法》提起诉讼，但可能无法直接作为境外发行人的股东依据境外当地法律提起诉讼，跨境维权成本和难度较高。

总结来说，存托凭证虽然赋予了投资者与基础证券持有人“基本相当”的资产收益和重大决策参与权，但在权利的行使路径上增加了一个“存托机构”作为中间桥梁，投资者无法像直接持有A股那样“一竿子插到底”地行使股东权利。

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