您好：
A股和港股通交易的手续费是分开扣费的，因为它们分属内地和香港两个独立的交易市场，结算规则、费用体系完全不同，各自的交易费用会分别从您的账户资金中扣除。

我来帮您拆解一下原因和操作注意点：
1. 市场独立性决定扣费分离：A股是内地交易所的交易品种，港股通是通过内地券商对接香港市场的交易通道，两者的清算结算由不同机构负责，费用自然分开计算和扣除。
2. 查看明细确认扣费：您每次交易后，可以在账户的交割单里分别查看A股和港股通的费用明细，每项扣费都清晰标注对应的交易市场。
3. 注意费用结构差异：港股通的费用除了交易佣金，还包含汇兑成本、结算费等，和A股的费用项目略有不同，交易前要提前了解清楚。

如果您想了解更多关于不同市场交易费用的细节，我可以帮您详细梳理。我司开户可享专属优惠，成功办理账户即享佣金政策支持，可转债、ETF佣金万0.5，期权按1.7元/张收取，专项两融利率低至3.1%，国债逆回购手续费一折，适配主流交易软件，客户经理一对一服务，咨询详情请添加右上角微信！