在南京可以办理期货开户的公司有很多，其中一些公司的佣金可能较低，比如银河期货、中信建投期货、民生期货、国泰君安期货、光大期货等。

选择期货公司时，除了关注佣金高低外，还需要考虑以下几点：
1. 手续费和保证金：不同期货公司收费标准不同，开户前可与客户经理协商调整，避免默认高费率。
2. 交易系统稳定性：大公司通常有更稳定的交易通道，适合短线或高频交易者。
3. 本地服务支持：如果偏好线下服务，可优先选择在南京有营业部的公司。
4. 评级和资质：AA级期货公司（如银河、中信建投等）通常更可靠。

开户方式
目前期货开户主要支持线上办理，流程简单（准备身份证、银行卡、手写签名），约20分钟即可完成。如需低手续费或特殊保证金调整，建议提前联系客户经理协商。

温馨提示：在选择期货公司时，不要只看佣金高低，还要综合考虑公司的实力、信誉、服务等方面。同时，期货交易存在风险，投资者在开户前应充分了解期货市场的规则和风险，谨慎投资。

以上就是关于您问题的答案，希望我的回答对您有帮助，如果有什么不明白的，点击微信添加好友或者电话都可以免费咨询，24小时在线服务。