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根据《上海证券交易所科创板股票上市规则》等相关法规，科创板发行人在以下主要情形下，应当终止其上市申请：

**一、 发行人主动要求终止**
发行人向交易所提交撤回发行上市申请文件，交易所经审核后同意其撤回，从而终止审核。

**二、 交易所审核中认定应当终止**
在交易所审核过程中，出现以下情形之一，交易所将终止发行上市审核：
1. **发行人主体资格问题**：发行人不符合科创板定位、国家产业政策，或者其基本发行上市条件发生重大不利变化。
2. **信息披露重大问题**：
* 发行人、其控股股东、实际控制人涉嫌重大违法违规被立案调查或侦查，导致审核无法继续进行。
* 发行上市申请文件存在虚假记载、误导性陈述或重大遗漏。
* 发行人阻碍或拒绝接受相关监督检查。
3. **未在规定时限内回复**：发行人未在规定时限内回复交易所审核问询，或未及时更新发行上市申请文件。
4. **财务数据过期**：发行上市申请文件记载的财务资料已过有效期，且逾期未补充提交。
5. **保荐人/证券服务机构失职**：保荐人、证券服务机构因被采取监管措施或执业受限，导致无法继续履职，发行人未及时更换。
6. **其他规则规定的情形**。

**三、 中国证监会注册环节终止**
即使通过交易所审核，在向中国证监会提交注册后，若出现以下情况，证监会可以决定终止注册程序：
1. 发行人主动要求撤回注册申请文件。
2. 发行人不符合法定发行条件或信息披露要求。
3. 其他应当终止注册的情形。

**总结来说**，终止上市申请的核心原因通常围绕**发行人资格丧失、信息披露存在重大缺陷、合规性出现重大问题**以及**审核程序无法正常推进**这几个方面。这体现了科创板“以信息披露为核心”的注册制理念，对企业的规范运作和持续经营能力提出了高要求。

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