在国投证券开户时，“通过支付宝开户”和“通过客户经理开户”主要有以下差别：

佣金费率

支付宝开户：佣金一般为券商默认标准（多为万三左右），系统自动下单，后续能调整的空间有限。客户经理开户：可依据资金量、交易频率、资产规模等协商更低佣金，长期交易更划算。

服务与后续支持

支付宝开户：开户后主要由券商总部线上客服统一对接，响应可能略慢。客户经理开户：有专人一对一服务，涉及账户维护、信息更改、业务咨询等问题可快速解决。

开户与投资指导

支付宝开户：流程自动化、简便，但缺少人工指导，新手可能对一些细节不了解。客户经理开户：可在开户和后续投资中提供操作指导、市场资讯和风险提示，降低入门难度。

个性化与资源匹配

支付宝开户：流程标准化，选项固定。客户经理开户：客户经理熟悉公司各类业务，可根据投资目标推荐适合的产品或账户方案。

总结：如果你追求方便快捷、初次尝试开户，支付宝方式足够；若资金量较大、重视佣金优惠和长期服务，建议通过客户经理开户更有利。