在网上申请证券公司的超低佣金账户时，可以通过以下流程进行：

选择券商并联系客户经理：首先，通过券商的官方网站、社交媒体或其他合作平台找到合适的客户经理。与客户经理沟通，告知你的资金量和交易频率，以协商获得一个更优惠的佣金费率。客户经理会为你提供一个专属的开户链接或二维码。

准备必要材料：确保你准备好以下材料：身份证、一类银行卡和手机号。

进行在线开户：下载券商的APP或访问其官方网站，按照要求填写个人信息，上传身份证件，并完成风险测评和视频验证。

绑定银行卡并设置密码：在开户过程中，输入你的银行卡信息，开通三方存管，并设置交易密码以确保账户安全。

签署协议并提交申请：阅读并签署电子协议后，提交开户申请。通常，审核过程需要1到3个工作日。

确认佣金费率：开户成功后，务必再次联系客户经理，确认实际的佣金费率是否与之前协商的一致。如有不一致，需及时与客户经理沟通解决。

通过以上步骤，你可以成功申请到一个超低佣金的证券账户。