要申请国元证券的低佣金，通常需要通过以下步骤与客户经理协商：

联系客户经理：首先，通过国元证券的官网、APP或者合作平台找到专属的客户经理。你可以通过电话、邮件或者在线客服联系他们，表达你希望降低佣金的需求。

说明需求：与客户经理沟通时，说明你的资金量、交易频率等情况，因为这些因素通常会影响佣金费率的调整。

确认费率：客户经理会根据你的具体情况，提供一个更优惠的佣金方案。确认双方达成一致的费率条件。

准备材料：准备好身份证、银行卡等必要材料，以便顺利完成开户或调整手续。

开户或调整：通过客户经理提供的专属链接或二维码，进入开户页面，按提示上传证件、完成视频认证、绑定银行卡并进行风险测评，提交开户申请。如果是已有账户，确认佣金调整。

确认调整：开户或调整后，及时与客户经理确认佣金是否已经调整到位。

另外，增加账户的资金量或提高交易频率可能会帮助你获得更低的佣金，但同时要注意控制投资风险。