1、发行制度不同

科创板为注册制，注册企业需经过多伦问询，注册审核流程较为严格，对企业市值、营收、净利等指标的要求也较高。

新三板注册公司提交挂牌申请材料后，全国股转公司会有针对性的提出询问，注册审核流程相对较为宽松。对企业的硬性量化指标仅需经营满两年。

2、交易方式不同

科创板为上交所，属于场内市场，与上海证券交易所的“创业板”较为类似，交易方式包括竞价方式、大宗交易和盘后固定价格交易等多种方式，股票成交量和流动性较强。

新三板为全国中小企业股份转让系统，属于场外市场。新三板企业挂牌时无公开发行环节，股票成交成交量小，流动性相对较差。

3、对投资者要求不同

参与科创板的个人投资者要求具备两年以上投资经验，且总资产要达到50万元，投资门槛较高。

新三板对个人投资者设置的门槛则更高，不仅需要具备两年以上投资经验，日终证券类资产还要达到100万元以上。

总体来说，目前科创板是比较受市场追捧的，也有部分新三板上市企业整部剧转板科创板

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