创业板新股申购限额由投资者持有的市值和当次网上初始发行数量共同决定。具体规定如下：

- 按市值计算：每5000元深市市值可申购一个申购单位，即500股，不足5000元的部分不计入申购额度。申购数量应当为500股或其整数倍。
- 按发行数量计算：最高申购数量不得超过当次网上初始发行数量的千分之一，且不得超过999,999,500股，如超过则该笔申购无效。

例如，某投资者T-2日（T日为网上申购日）前20个交易日的深市日均市值为10万元，则其可申购额度为100000÷5000×500 = 10000股。若某创业板新股网上初始发行数量为1000万股，则该投资者最高申购数量不得超过10000000×0.001 = 10000股；若网上初始发行数量为1亿股，则最高申购数量不得超过999,999,500股。