在跨境股票交易解决手续费相关税收协定问题，可按以下步骤操作。

首先，了解协定内容。详细研究本国与投资目标国家之间的税收协定，明确协定中关于金融交易手续费税收的条款，比如是否存在减免政策、税率差异等关键信息。可以通过政府税务部门官网、专业法律数据库获取协定文本，也可咨询专业律师或税务顾问。

其次，核查券商资质和服务。选择有跨境业务经验、熟悉税收协定的券商。与券商沟通，了解其在处理手续费税收方面的流程和方法，确认能否提供合规、准确的税务申报服务。

然后，准确记录交易信息。在交易过程中，完整、准确地记录每一笔交易的手续费明细，包括金额、支付时间、交易地点等，为后续税务申报和审查提供依据。

再者，主动申报纳税。依据税收协定和当地税务法规，按时、如实申报手续费相关税收。若不确定具体申报流程和要求，可向当地税务机关咨询，避免因申报不当产生税务风险。

最后，定期关注政策变化。税收协定和相关政策可能会随时间调整，要持续关注政策动态，及时调整交易策略和税务处理方式，确保始终符合法规要求。