红筹企业发行的存托凭证和普通股票存在一些明显差异。首先，普通股票是公司直接发行的所有权凭证，而存托凭证是境外上市公司将部分已发行股票委托给存托机构，由存托机构发行的代表这些股票权益的凭证。

交易方面，普通股票一般在本地证券交易所交易，而红筹企业存托凭证交易涉及跨境转换等，相对复杂些。并且，普通股票的股东可以直接行使投票权等股东权利，存托凭证持有人的权利行使可能要通过存托机构，流程没那么直接。

从市场影响看，红筹企业存托凭证能让境内投资者参与境外优质企业投资，但也面临境外市场波动等额外风险。

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