投资港股通标的股票面临以下主要风险：
1. 汇率风险：港股通股票以港币报价，以人民币交收，人民币兑港币汇率波动会导致投资者的收益或本金出现增减变化。
2. 股价波动风险：香港市场对股票交易价格不设置涨跌幅限制，且实行T+0交易机制，加之内地与香港在信息披露、公司行为和退市制度等方面存在差异，个股股价受到意外事件驱动的影响，波动幅度可能相对A股更为剧烈。
3. 交易时间差异风险：香港出现台风、黑色暴雨或者联交所规定的其他情形时，联交所将可能停市，投资者将面临在停市期间无法进行港股通交易的风险。
4. 额度控制风险：在联交所开市前时段、持续交易时段或收市竞价时段，港股通当日额度使用完毕的，投资者将面临不能通过港股通进行买入交易的风险。
5. 信息不对称风险：部分港股通公司注册地、主营业务经营所在地法律法规、语言或文化习惯等与内地存在差异，导致投资者较难获取或理解公司实际经营状况相关资讯。
6. 个股流动性风险：港股通部分中小市值股票成交量相对较少，流动性较为缺乏，投资者持有此类股票，可能因缺乏交易对手面临小量抛盘即导致股价大幅下降的风险。
与A股投资风险的区别主要体现在以下方面：
1. 涨跌幅限制：A股设有涨跌停板制度，而港股通标的股票一般不设涨跌幅限制，港股股价受意外事件影响时波动更剧烈。
2. 交易制度：A股主要是T+1交易制度，而港股通是T+0交易制度，当天买入的证券当天可以卖出，这增加了交易的灵活性，但也可能导致投资者因频繁交易而增加风险。
3. 交收制度：A股是T+1交收，而港股通是T+2交收。在T+2交收制度下，若投资者T日买入股票，T+2日才过户到名下，期间若遇分红派息等，可能无法享有相关权益。
4. 退市制度：A股有风险警示板等相关制度，退市流程相对较为明确和量化。而联交所不设风险警示板，采用非量化的退市标准，且在上市公司退市过程中拥有相对较大的主导权，使得港股通上市公司的退市情形较A股市场更为复杂。
5. 市场联动性：港股市场外汇资金可自由流动，受全球宏观经济和货币政策变动的影响较大，与海外资金流动高度相关。相比之下，A股市场受国内宏观经济和政策影响更为直接，与全球市场的联动性相对较弱。