同业存单：是由银行业存款类金融机构法人（如商业银行、政策性银行等）在全国银行间市场上发行的记账式定期存款凭证。本质上是一种金融机构的债务融资工具，是银行等金融机构主动负债的一种方式。银行通过发行同业存单来筹集资金，期限一般有1个月、3个月、6个月、9个月和1年等，利率根据市场供求关系和发行银行的信用状况等因素确定。

同业存单基金：是一种专门投资于同业存单的基金产品。它主要投资于银行发行的同业存单，通过汇集众多投资者的资金，由基金管理人进行专业化投资运作。同业存单基金的特点是风险相对较低、流动性较好，收益相对较为稳定，适合追求稳健收益、风险偏好较低的投资者。

二者主要区别包括：

产品性质：同业存单是金融机构的债务凭证；同业存单基金是基金产品，投资者购买基金份额，成为基金的持有人，通过基金间接投资同业存单。

投资主体：同业存单的投资者主要是银行、保险、基金等金融机构；同业存单基金的投资者可以是个人投资者和机构投资者，普通投资者也可参与。

收益与风险：同业存单收益相对固定，只要发行的金融机构不出现违约，投资者可按约定获取利息收益；同业存单基金收益受所投资同业存单的表现影响，收益不固定，虽风险相对较低，但仍存在波动风险。

流动性：同业存单未到期前，一般不能提前支取，可在二级市场转让，但流动性相对有限；同业存单基金流动性较好，投资者可在开放期内赎回基金份额。