通过同花顺开国泰君安的股票账户有一些潜在的坏处和局限性：

佣金费用较高：通过第三方平台（如同花顺）开设的账户，佣金可能不如直接通过券商官网或线下营业部开户来得优惠。第三方平台通常会收取一定的服务费用，这可能导致交易成本上升。

服务支持有限：通过同花顺开户后，可能在享受国泰君安证券的部分服务时会受到限制。例如，某些专属的投资顾问服务或客户经理的支持，可能无法通过第三方平台获得。

信息安全风险：虽然同花顺是一个知名的金融信息服务平台，但通过第三方平台进行开户，增加了信息传输的环节，可能存在信息泄露的风险。确保个人信息和资金安全至关重要。

功能限制：通过第三方平台开户，可能无法享受到国泰君安证券提供的全部功能和服务。例如，某些特定的理财产品或专属活动，可能仅限于通过券商直接开户的客户。

客户关系：通过第三方平台开户，客户关系管理可能会受到影响。券商可能更倾向于为直接开户的客户提供更优质的服务和资源。

总之，通过同花顺开国泰君安的股票账户虽然方便快捷，但在佣金费用、服务支持、信息安全等方面可能存在一定的局限性。如果对这些方面有较高要求，建议直接通过国泰君安证券的官网或线下营业部进行开户。