期货套利交易与单边交易在多个方面存在显著差异。以下是对两者的详细比较：

1. **利润来源**：
- 期货套利交易：利润主要来源于不同期货合约或不同品种之间的价差变化。套利者通过同时买入和卖出两种相关期货合约，利用价差的变化获利。
- 单边交易：利润来源于单一期货合约价格的波动。单边交易者根据对市场价格趋势的判断，买入或卖出期货合约，通过合约价格的上涨或下跌获利。

2. **交易方式**：
- 期货套利交易：属于双向交易，套利者需要在相关期货合约之间或期货与现货之间同时建立多头和空头头寸。
- 单边交易：属于单向交易，即在一段时间内对单一期货合约建立多头或空头头寸。

3. **交易成本**：
- 由于套利交易在同一时点上涉及多个合约的买卖，且套利者承担的风险相对较小，因此期货交易所通常对套利交易收取较低的保证金。
- 单边交易涉及单一合约的买卖，且单边交易者承担的风险较大，因此期货交易所对单边交易收取较高的保证金。

4. **风险程度**：
- 期货套利交易的风险主要来源于价差变动的风险。由于相关期货合约价格变动方向具有一致性，因此价差变动幅度一般要小于单一期货合约价格波动幅度，套利交易相对单边交易所承担的风险更小。
- 单边交易的风险主要来源于单一期货合约价格变动的风险。单边交易者需要准确判断市场价格趋势，否则可能面临较大的亏损风险。

5. **市场策略**：
- 期货套利交易需要遵循一定的原则，如买卖方向对应、买卖数量相等、同时建仓、同时对冲以及合约相关性等。这些原则有助于降低套利交易的风险并提高盈利能力。
- 单边交易更注重对市场价格趋势的判断和持仓管理。单边交易者需要根据市场情况灵活调整持仓策略，以应对市场波动带来的风险。

综上所述，期货套利交易与单边交易在利润来源、交易方式、交易成本、风险程度和市场策略等方面存在显著差异。投资者在选择交易方式时需要根据自身的风险承受能力、资金实力和市场判断能力等因素进行综合考虑。