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交易1万元国债逆回购想要协商降低佣金可以参考以下方法：

1.比较佣金费率：不同券商的佣金费率存在差异，有的券商可能提供较低的佣金率。投资者可以通过比较不同券商的佣金费率，选择佣金较低的券商进行交易。

2.新客户优惠：一些券商可能会针对新客户推出减免佣金的优惠活动，如首笔交易低佣优惠。投资者可以定期关注券商的官方网站，APP或通过客服咨询是否有此类活动。

3.协商佣金率：如果投资者计划进行大额的国债逆回购交易（尽管此处是1万元，但策略同样适用），可以尝试与券商的客户经理协商，看是否能够基于交易规模获得更低的佣金率。

4.建立长期关系：成为某家券商的长期客户并保持较高的交易活跃度，有时也能在佣金费率上获得一定的优惠。投资者可以通过持续的交易和资金管理，与券商建立稳定的合作关系，从而获得更优惠的佣金费率。

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