您好，重庆本土佣金低的证券公司有以下几家：华泰证券，国泰君安，广发证券，中信建投，申万宏源，可以通过线上客户经理给您申请开户，客户经理手中一般都是有低佣金开户渠道的，账户开通后还可以给您提供VIP专属服务。

重庆本土佣金低的证券公司申请开户协商方法如下：

1.联系客户经理：在选择了证券公司后，你可以提前联系该证券公司的线上客户经理。客户经理通常会有一定的优惠权限，能够帮助你申请到更低的佣金费率。

2.了解佣金结构和优惠政策：在与客户经理沟通时，详细了解该公司的佣金结构和优惠政策。了解哪些费用可以调整，以及他们是否提供根据交易量或资金量调整佣金的政策。

3.提出降低佣金的要求：在了解了佣金结构和优惠政策后，你可以向客户经理提出降低佣金的要求。你可以根据自己的交易量，资金量等因素来提出合理的费率要求。

4.协商达成协议：客户经理会根据你的要求和公司的政策来协商佣金费率。在协商过程中，你可以与客户经理进行多轮沟通，以达成双方都满意的协议。

5.注意后续服务：在降低佣金费率后，你还需要关注后续的服务质量。确保证券公司能够提供稳定的交易平台，及时的市场信息和专业的投资顾问服务。

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