南京确实有国元证券，是一家具有综合金融服务能力的券商。

要申请低佣金账户，您可以按照以下步骤进行：

1. 在南京当地的国元证券营业部咨询：您可以通过国元证券官方网站或其他渠道查找到南京的国元证券营业部的联系方式，然后与他们取得联系，咨询关于低佣金账户的申请事宜。

2. 准备相关材料：通常，在申请低佣金账户时，您需要准备一些身份证明和相关财务材料，例如身份证、银行卡、手机号码、居住证明（如水电费单等）等。

3. 填写申请表并提交相关材料：国元证券会提供申请表格，您需要填写个人信息和其他相关信息，并将其与准备好的材料一同提交给国元证券的工作人员。

4. 进行风险评估：根据相关金融法规，券商需要对投资者进行风险评估，以确保投资者的风险承受能力与选择的低佣金账户相符。您可能需要回答一些关于投资经验、风险偏好等方面的问题。

5. 等待审核结果：提交申请后，您需要等待国元证券进行审核。一般来说，审核的时间会在几个工作日内完成。审核通过后，您将获得低佣金账户的开通信息。

请注意，在申请低佣金账户时，可能会有一些条件和限制。因此，在申请前，您最好与国元证券的工作人员进行咨询，了解具体的申请流程和要求。