学校的保险与农保（即新型农村合作医疗）在参保和报销方面确实存在冲突，具体分析如下：

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一、参保冲突
学校的保险和农保都属于社会基本保险范畴，根据相关规定，参保人员不能重复参加和享受待遇。因此，在同一时间内，学生只能选择其中的一种保险进行参保。如果学生已经在学校参加了保险（通常属于学校所在地的城镇居民医保），那么就没有必要再参加家乡的农保。
二、报销冲突
虽然学校的保险和农保在报销方面不能直接同时进行，但并不意味着两者完全不能报销。实际上，当学生发生医疗费用时，可以根据实际情况选择其中一种保险进行报销。但需要注意的是，不能重复报销已经由另一种保险报销过的部分。
具体来说，如果学生在学校所在地发生医疗费用，并已经通过学校保险进行了报销，那么就不能再向农保申请报销。反之亦然。如果学生在家乡发生医疗费用，且家乡已经实施了新农合与居民医保的合并（如某些地区），那么可以根据当地的报销政策选择适合的保险进行报销。
三、报销流程
对于已经选择其中一种保险进行报销的学生，需要按照相应的报销流程进行操作。一般来说，报销流程包括选择医保定点医院、前期个人垫付医药费、准备出院资料、联系保险业务员或前往保险公司网点递交资料、等待保险公司审核并转账等步骤。
四、建议
鉴于学校的保险和农保在参保和报销方面的冲突，建议学生根据自身实际情况和需求选择合适的保险进行参保。如果学生大部分时间都在学校度过，且学校保险能够提供较好的医疗保障，那么可以选择参加学校保险。如果学生在家乡的时间较长，且家乡的医疗资源较为丰富，那么也可以考虑参加农保。但无论选择哪种保险，都需要确保在发生医疗费用时能够及时获得报销。
此外，学生还可以关注当地社保政策和保险产品的变化，以便在需要时做出更加明智的决策。同时，也可以向学校或当地社保机构咨询相关政策和流程，以便更好地了解和使用自己的保险权益。