1、比门槛：场内货币基金更亲民
作为现金管理工具，从参与门槛来看，逆回购作为相对货币基金的门槛较高，上交所逆回购的参与门槛是10万元起投，深交所是1000元起投。而货币ETF二级市场参与门槛多数是1万，一级市场在1000或者100，如南方理财金H是100元起投，相比之下，场内货币基金更亲民。
2、比期限：场内货币基金更灵活
投资期限来讲，逆回购有1天、2天、3天、4天、7天、14天、28天、91天、182天9个品种，隔夜回购成交最活跃，其次为7日逆回购。而目前主流的场内货币基金，如南方理财金H均享受日内“T+0”回转交易，投资者当日买入的基金份额，当日可以立刻卖出，且可以无限次重复买卖基金份额，日内回转交易可以确保投资者在享受基金收益的同时，不会错过任何交易机会。相比之下，场内货币基金的灵活度更高，在持有期限上也更为多变。
3、比收益：场内货币基金更稳定
收益能力方面，长期来看基本上场内货币基金收益要高于逆回购收益。此外两点半以后正回购的融资需求会大幅减少，因此两点半以后逆回购基本都会跳水，且两点半前逆回购一旦成交后资金当日无法再度利用，场内货币基金则享受日内“T+0”回转交易，买入即可计息，卖出资金即可使用。另外，每逢周末或者节假日，交易所休市，若在周五进行逆回购，则周六周日没有收益。而货币基金则不一样，周五买入，周六周日也能享受收益，因此场内货币基金成为了投资者的假期理财首选。
4、比风险：两者基本持平
一般来说，国债逆回购非常安全，只要逆回购收益大于交易手续费都不会亏损。而货币基金的投资方向主要包括现金，通知存款，短期融资券(包括超级短期融资券)，一年以内(含一年)的银行定期存款、大额存单等银行存款，剩余期限在397天以内(含397天)的债券、中期票据以及资产支持证券，期限在一年以内(含一年)的债券回购和中央银行票据以及中国证监会、中国人民银行认可的其他具有良好流动性的货币市场工具，这使得货币基金的运作风险也非常低，具有极高的安全性。
5、比费用：场内货币基金更划算
交易成本来讲，逆回购交易费用从隔夜回购到28天以上分别从0.1%%到3%%依次递增。场内货币基金一般无交易费用，如南方理财金H的申购费、赎回费均为0，并与超过64家券商达成减免交易佣金的协议。
6、比策略：场内货币基金更多元
从交易策略上看，逆回购的交易策略比较单一，而场内货币基金的交易策略则比较多样化。以南方理财金H为例，场内货币基金的交易策略有如下几种：
(1)日内趋势投资策略，在二级市场利用价差套利
由于理财金H可以实现“T+0”当日回转交易，投资者可以通过低买高卖，在不占用过夜资金的前提下获取可观的日内价差套利收益。比如早上开盘在100左右时候买入，到中午或者下午价格充分反映了净值后抛出。
(2)一二级市场套利策略，通过卖出并申购进行套利
若理财金H的二级市场价格明显高于其预估净值(当前定价情形下，价格高于100.006就有溢价)，投资者可以卖出并申购进行套利。该套利主要分为两种：
①卖出并申购套利：对于前期已通过申购或买入的方式持有南方理财金H的投资者，若南方理财金H的二级市场价格明显高于其预估净值，投资者可以卖出二级市场份额并申购进行套利。
②买入并赎回套利：若南方理财金H二级市场价格明显低于其预估净值，投资者可以通过买入并赎回的方式套利。
(3)节日投资策略，利用节假日价差套利
场内货币基金的交易价格会受到节假日效应的影响，节假日投资策略指的是利用不同货币基金的申赎买卖时间及计息时间的不同在节假日显现的特点来获取收益。由于每个周五和公共长假前的最后一个交易日，理财金H的二级市场价格会明显走高，因为该日买入可获得当日及节假日休市期间的累计多天收益。加之回购利率此时通常走低，以机构为主的闲置资金愿意以较高的价格在二级市场买入。投资者可以在周一到周四之间买入理财金H，周五卖出，博取一定的买卖价差。长假休市时间越长，二级市场价格超出净值就会越多，价差空间也越大。