两地节假日不一致时，港股通遵循“两地都开市才开通”的“双重开门”原则。只要A股或港股任意一方休市，港股通当日就会暂停交易。这意味着，无论是A股开市而港股因佛诞、圣诞节等休市，还是港股开市而内地放长假，投资者都无法进行任何买卖操作。此外，港股存在圣诞、元旦前夕等半日市，当日港股通仅上午交易，且该日不计入交收周期。

由于港股通实行T+2交收制度，节假日会直接导致资金交收大幅顺延。例如，在长假前卖出股票，原本T+2日可用的资金可能要等到节后第二个交易日才能取出。若交收日正好遇到非交收的半日市或假期，交收还会进一步推迟。在分红方面，节假日的顺延效应同样显著。股息到账的计算口径仅统计两地共同开市的港股通交易日，所有节假日和周末均不计入时长。在股权登记日方面，若香港市场权益登记日处于非对称节假日期间，境内权益登记日会相应调整。此外，港股通关闭期间，投资者可能因无法操作而错过配股缴款等公司行为。