根据“全国中小企业股份转让系统业务规则（试行）”的有关规定，在新三板挂牌的股票，可以采取协议方式、做市方式、竞价方式或其他中国证监会批准的转让方式进行交易。目前，新三板共设计和实施两种股票转让方式，即协议转让、做市转让。
挂牌股票采取协议转让方式的，全国股份转让系统公司同时提供集合竞价转让安排，全国股份转让系统对股票转让不设涨跌幅限制。挂牌股票采取做市转让方式的，须有2家以上从事做市业务的主办券商（以下简称“做市商”）为其提供做市报价服务。做市商必须连续报出其做市证券的买价和卖价，若投资者的限价申报满足成交条件，则新三板做市商在其报价数量范围内，有按其报价履行与其成交的义务。也就是说，投资者需要买卖股票时，买卖双方不直接成交，而是通过新三板做市商作为对手方，只要是在报价区间就有成交义务