截至收盘，两市机构资金合计净流出190.36亿，44个行业中有4个行业呈现净流入状态。其中，机构重点增持：银行（7.67亿）、保险（1.50亿）、高速公路（0.18亿）、酿酒行业（0.09亿）；机构重点抛售：医药行业（-20.14亿）、电子元件（-19.55亿）、电子信息（-16.36亿）、房地产（-15.56亿）、汽车行业（-12.99亿）。

个股方面，10月16日机构净流入前五的股票分别为：南通科技（3.03亿）、中国北车（2.41亿）、中国南车（2.32亿）、浦发银行（2.26亿）、中国中铁（1.80亿）；机构净流出前五的股票分别为：成飞集成（-2.79亿）、海王生物（-2.41亿）、太钢不锈（-2.20亿）、太平洋（-2.01亿）、江淮汽车（-2.01亿）。