融资融券账户在不同城市的银行进行资金划转存在一定限制。

首先，在时间方面，一般只能在交易日的 9:00-15:00 或 9:00-16:00 之间进行银证转账，非此时间段则无法操作。

其次，存在维持担保比例限制，当维持担保比例超过 300% 时，投资者方可提取保证金可用余额中的现金或可充抵保证金的有价证券，且提取后维持担保比例不得低于 300%。

再者，资金用途有限制，融资资金限于偿还融资债务，融券卖出所得资金限于买券还券，未了结相关融券交易前，不得挪作他用。

另外，当日卖出证券所得资金，需等次一交易日才能转出。

从划转方式来看，融资融券账户与普通账户的资金不能直接划转，需先将资金从融资融券账户转入银行，再从银行转至普通账户。

而且，券商可能会对单次划转金额设置上限或下限，具体金额依券商规定执行。

同时，若融资融券账户因违规操作等被冻结或限制，资金划转操作也会受影响。

总之，融资融券账户资金划转限制主要源于风险控制和交易规则要求，与所在城市的银行并无直接关联，无论在哪个城市的银行进行操作，都需遵循上述规定。

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