方正证券作为中国知名的证券公司，其交易手续费的计算涉及多个方面。根据历史及最新信息，方正证券对于股票交易收取的主要费用包括佣金、印花税和过户费：

1. 佣金：方正证券对股票交易收取的佣金费率一般在万分之三（0.03%）至千分之三（0.3%）之间浮动，并设有低5元的收费标准，这意味着实际收取的佣金可能会根据交易金额的不同而变化，且通常买卖双方都需要支付。
2. 印花税：仅针对卖出股票时收取，固定为成交金额的万分之五，由国家统一规定，无法调整。
3. 过户费：目前沪深两市均会收取过户费，但沪市按照成交金额的十万分之一收取

具体到某一笔交易，投资者需要支付的总手续费=买入或卖出的佣金+卖出时的印花税（如适用）+沪市卖出或买入时的过户费（深市只考虑卖出的印花税）。其中，佣金部分可以与客户经理协商以争取更优惠的费率，尤其是在资金量较大或者交易较为频繁的情况下。

为了确保获取最准确的收费标准，请直接咨询方正证券官方客服或前往当地营业部了解最新的服务价格及优惠政策。同时，不同时间段以及不同地区可能会有不同的政策，所以实时查询并确认是最为稳妥的做法。