1、交易场所不同：北交所在北京证券交易所交易；而沪市在上海交易所交易，深市在深圳交易所交易。
2、上市企业不同：北交所上市的企业主要是一些中小型科技企业；而沪深交易所主板的企业主要是一些成熟的企业。
3、交易规则不同：北交所实行T+1交易，股票涨跌幅限制为30%，新股上市首日不设涨跌幅限制，但设有临时停牌机制，上市涨跌幅达到30%和60%时各停牌10分钟。沪深两市实行T+1交易，沪深两市股票涨跌幅限制为10%，创业板和科创板股票涨跌幅限制为20%，沪市新股上市首日涨跌幅达到规定的限制，停牌30分钟，深市新股上市首日盘中涨幅与开盘涨幅之差首次达到10%时，交易所对其实施临时停牌30分钟，创业板和科创板新股上市盘中涨幅与开盘涨幅之差首次达到30%，停牌10分钟，复牌后涨跌到60%的，再停10分钟，不过停牌的时间不管多长，都要在14:57复牌。

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