北交所与沪深主板的退市制度虽均包含交易类、财务类、规范类和重大违法类四种强制退市情形，但在具体标准与流程上存在显著差异。在交易类退市方面，北交所对交易量、市值、股东人数等指标的观察周期更长、容忍度更高。例如，北交所要求股价连续60个交易日低于1元才触发面值退市，而主板仅为连续20个交易日；北交所要求市值连续60个交易日低于3亿元才触发退市，而主板为连续20个交易日低于5亿元；北交所还设有股东人数少于200人且连续60个交易日的退市指标，而主板并无此要求。

在财务类退市方面，北交所的营收门槛更低，体现其对创新型中小企业的包容性。其标准为“利润总额/净利润/扣非净利润孰低为负，且营业收入低于5000万元”，而主板对应门槛为3亿元。在流程方面，主板设有“ST”和“ST”两级风险警示，而北交所**仅设“ST”一档。此外，北交所取消了暂停上市和恢复上市环节，且交易类退市不设退市整理期，直接摘牌。其退市整理期涨跌幅限制为±30%**，高于主板的±10%。