科创板代码688开头，归属上交所，主攻硬科技大企业，北交所代码8开头，服务专精特新中小企业，两者开通门槛一样，都需要20日日均50万资产、24个月A股交易经验，多数券商已有科创板权限可直接开通北交所，不用重复验资。交易规则差别较大，科创板日常涨跌幅20%，新股前5日无涨跌幅；北交所日常±30%，新股首日不设涨跌幅，还带有价格笼子机制，北交所个股普遍盘子更小，整体流动性弱于科创板，滑点风险更高，买入申报都是100股起、1股递增。企业来源上，科创板企业直接IPO申报，北交所公司必须先在新三板创新层挂牌满一年才能上市，上市财务门槛北交所整体更低，以中小型细分企业为主，科创板更多是芯片、创新药这类体量偏大的硬核科技公司。打新机制也不一样，科创板是摇号抽签，北交所新股采用按资金比例配售，碎股按时间优先分配。另外两者退市标准、转板规则不同，北交所满足条件可以申请转板到科创板或者创业板，转板仍要重新审核，不等于自动升级。

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