股票回购会减少股东权益，是因为上市公司回购股份后通常会作为库存股持有或者注销，库存股属于公司自己持有而非外部股东权益，因此会冲减整体股东权益总额，理解这个逻辑可以按照以下步骤梳理：
1、先明确会计记账规则，上市公司回购股票需要动用公司自有资金，出资回购完成后，回购得到的股份不计入外发股东权益，会对应减少资产负债表中股东权益的总额。
2、如果上市公司选择注销回购的股份，会直接减少公司的股本总额，进一步拉低股东权益的账面规模。
3、区分库存股和注销两种情况，无论哪种处理方式，都不会增加外发股东的权益规模，因此会体现为股东权益减少。

需要注意，股票回购减少股东权益是会计处理的结果，不代表此次操作一定对普通投资者不利，很多回购是上市公司向市场传递看好自身发展的信号。
举例来说，上市公司拿出10亿自有资金回购股票，这10亿原本属于股东权益的部分，换成了公司持有的库存股，就会从外发股东权益中扣除，账面就会体现股东权益减少。

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