科创板新股申购采用市值配售制度，其申购资格与投资者持有的沪市非限售A股市值直接挂钩。具体而言，投资者在申购日（T日）前两个交易日（T-2日）之前的20个交易日内，所持沪市日均市值需达到1万元以上，方可获得申购资格，深市及北交所的市值不计入此范围。在额度换算上，每5000元沪市日均市值对应1个申购单位，即500股，申购数量须为500股或其整数倍；顶格申购上限通常不超过当次网上初始发行数量的千分之一。
申购操作完成后，系统按每500股分配一个配号，投资者可在T+1日查询配号结果，主承销商随后在公证监督下组织摇号抽签，中签者每个号码可认购500股。中签后，投资者须在T+2日日终前确保账户有足额认购资金，系统届时自动扣款；若12个月内累计出现3次中签未足额缴款，将被暂停6个月的新股申购资格。值得注意的是，参与科创板打新还必须提前开通科创板交易权限，需满足参与证券交易24个月以上、权限开通前20个交易日日均资产不低于50万元等条件；申购当日无需预先缴款，中签后才需准备资金。