港股通与直接在香港券商开户，在红利税上的核心差异体现在税率高低与计税规则上，整体而言，直接香港开户的税负成本显著更低。通过港股通投资，内地个人投资者取得的股息红利，统一按20%的税率代扣个人所得税。这一税率不随持股时间长短而变化，不存在A股那样的阶梯式减免，无论持有几天还是几年，均按固定比例扣缴。对于部分在开曼、百慕大等地注册的红筹股，由于需先缴纳境外预提税，综合税负最高可达28%。

而在香港直接开户，情况则更为复杂，但总体税负更低。首先，对于H股（内地注册的企业），根据内地与香港的税收安排，上市公司会代扣10%的预提股息税。其次，对于香港本地注册的上市公司股票，香港本身不征收股息税，分红可全额到账，税负为0。此外，对于境外注册的红筹股，通常也只需承担最高10%的单层预提税。

简而言之，港股通对所有标的统一征收20%且无减免；而直接香港开户，H股仅10%，香港本地股甚至为0。两者在卖出股票时产生的资本利得，内地税务层面均暂不征收所得税。港股通的优势在于开户便捷、资金无需跨境；而直接开户则在长期持有高股息个股时，税收成本优势极为明显。