当自由现金流、净利润、扣非净利润三者出现明显背离时，可能代表上市公司经营存在以下隐患：

首先，自由现金流为负且与净利润背离，可能意味着公司虽有盈利，但资金回笼不佳，或者在资本支出等方面花费过多，导致缺乏可自由支配的现金，可能影响未来的发展和偿债能力。

其次，净利润与扣非净利润背离较大，说明公司的盈利可能主要依赖于非经常性损益，如政府补贴、资产处置收益等，而非核心业务的稳定盈利，这可能暗示公司核心竞争力不足，持续盈利能力存疑。

再者，若自由现金流、净利润和扣非净利润三者都背离，情况可能更为复杂和严重，公司可能存在财务操纵、资金链紧张、业务结构不合理等多种问题。

理财有风险，投资需谨慎。在分析上市公司财务状况时，要综合多方面因素。如果你想了解更多关于如何深入分析财务指标的知识，欢迎点击头像添加微信进一步沟通。