账户托管制度上，沪市实行指定交易，一个沪 A 账户同一时间只能绑定一家券商，更换券商需要办理撤指定；深市为券商托管模式，同一深 A 账户可同时挂多家券商，转户无需撤指定。新股申购市值两市相互独立、不能通用，沪市每 20 日日均 1 万元市值对应 1000 股申购单位，深市每 5000 元市值对应 500 股申购单位。

两市目前股票尾盘均为 14:57-15:00 收盘集合竞价，核心差异在于多重最优价格判定，存在多个符合条件价格时，沪市选取买卖未匹配差额最小价位，深市选取最靠近前日收盘价的价位。盘后固定价格交易申报时段不同，深市 9:15 起即可提交盘后委托，沪市要等到 9:30 才能申报盘后单。

板块门槛相互区分，沪市 688 科创板需要 50 万资产门槛，深市 300 创业板需要 10 万资产门槛。交易申报规则大体一致，卖出零碎不足 100 股股份两市都允许一次性申报卖出。

大宗交易申报起始时间有区别，深市大宗 9:15 接受申报，沪市大宗 9:30 才开放申报。另外需要留意，两市临时停牌、异动监管的认定细则存在细微差异，价格笼子、市价申报细则也存在小幅区别。

实操层面最简单的区分方式，60、688 开头标的遵循沪市规则，00、300 开头标的遵循深市规则。

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