北交所交易手续费包含券商佣金、印花税、过户费、交易所经手费四项；和沪深主板相比，印花税、过户费规则一北交所交易手续费包含佣金、印花税、过户费、经手费四项，和主板交易费用核心差异集中在经手费收取范围两方面，整体交易成本北交所更高。

北交所全部费用统一双向或单向规范收取，佣金为券商收取服务费，双边计费、上限 3‰；印花税仅卖出单边按成交金额 0.05% 征收；过户费买卖双向按 0.001% 收取；经手费双边 0.0125%，属于交易所规费，多纳入全佣打包计费。沪深主板同样由佣金、印花税、过户费、经手费构成，但主板经手费仅 0.00541%，远低于北交所。

对比两类市场，印花税收费标准完全一致无差别，仅券商佣金可与券商协商调整。投资者计算北交所交易手续费时，需留意全佣、净佣区分，净佣会单独加收经手费，容易拉高单次交易成本。

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