港股通的交易时间和A股存在明显差异，主要体现在以下几个方面：
每日交易时段
- A股：9:15 - 9:25为开盘集合竞价（9:20后不可撤单），9:30 - 11:30为上午连续交易时段，11:30 - 13:00为午休（1.5小时），13:00 - 14:57为下午连续交易时段，14:57 - 15:00为收盘集合竞价，15:00收盘。
- 港股通：9:00 - 9:30为开市前时段（9:00 - 9:15可申报和撤单，9:15 - 9:30仅申报不可撤单），9:30 - 12:00为上午连续交易时段，12:00 - 13:00为午休（1小时），13:00 - 16:00为下午连续交易时段，16:00 - 16:10为收市竞价交易时段（随机收盘），16:10真正结束交易。

一句话总结就是，港股通早15分钟开盘、晚1小时10分收盘、午休更短、全天多1.5小时交易。

交易日
- A股：按照内地法定节假日休市，如春节、国庆等。
- 港股通：只有内地和香港两边市场都开市才进行交易。香港的假期（如耶稣受难节、佛诞、圣诞等）会导致港股通休市，而A股正常交易；内地的假期（如国庆、春节）会使A股和港股通都休市。另外，在圣诞前夕、新年前夕及农历新年前夕，如果不是周末，港股通只有半天交易（上午交易，下午休市）。

特殊情况
- 收市竞价：港股通在16:00 - 16:10设有收市竞价时段，适用于恒生综合大型股/中型股指数成分股、A + H股等；而A股仅深市主板在收盘前有3分钟集合竞价。
- 恶劣天气：当香港出现台风或黑色暴雨警告信号时，香港交易所可能会宣布停市，届时港股通也会暂停交易。

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