港股通设置了每日额度限制，自2018年5月1日起，沪港通下港股通和深港通下港股通每日额度均为420亿元人民币。两市的每日额度由沪、深两家证券交易所分别控制、实时监控并在官方网站公示，互不影响、互不调剂。

额度计算方式为：当日额度余额=每日额度 - 买入申报金额 + 卖出成交金额 + 被撤销和被交易所拒绝接受的买入申报金额 + 买入成交价低于申报价的差额。在交易时段，9：00 - 9：15时段，若每日额度余额小于或等于0，该时段后续仅接受卖出、撤单申报，若因买单撤销等使余额大于0，9：30开始重新接受买入申报；9：30之后时段，额度余额小于或等于0时，剩余交易时间不再接受买入申报，但接受卖出申报。上交所证券交易服务公司会在其指定网站暂定每分钟更新当日额度余额显示信息，额度用完会予以披露。

自2024年5月1日起，港股通已取消总额度限制，投资者在港股通交易中不再受全年累计交易总额的限制。此前试点初期，港股通总额度为2500亿元人民币，总额度管理机制是，总额度余额=总额度 - 买入成交总金额 + 卖出成交总金额，在每个交易日结束后计算，当总额度余额少于一个每日额度时，上交所SPV将于下一个交易日暂停接受新的买单。

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