是的，两融账户和普通账户打新是分开的。虽然两个账户属于同一投资者，但系统视为独立账户处理。首先，申购操作必须在各自账户中单独进行，不能自动合并；其次，同一只新股只能在一个账户中有效申购一次，若两个账户都提交，通常以首次申报为准，另一笔会被视为无效。市值方面，目前多数券商已实现普通账户与两融账户的股票市值合并计算打新额度（沪市、深市分别合并），但融资买入的股票计入市值，融券卖出部分不计。不过，权限需分别开通，比如科创板、创业板打新，两融账户要单独满足资产和交易经验要求。另外，北交所新股仅支持普通账户申购，信用账户无法参与。中签缴款时，两融账户优先使用自有资金，不足部分不能直接用融资资金支付。因此，尽管市值可能合并，但操作、权限和缴款均独立，建议集中市值到一个账户以简化流程、避免废单。
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