国债逆回购的手续费按交易金额的一定比例收取，费率根据回购期限的不同而有所变化。具体标准如下：
|回购期限|手续费率|每10万元手续费|
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|1天期|0.001%|每10万元1天收取1元|
|2天期|0.002%|每10万元2天收取2元|
|3天期|0.003%|每10万元3天收取3元|
|4天期|0.004%|每10万元4天收取4元|
|7天期|0.005%|每10万元7天收取5元|
|14天期|0.01%|每10万元14天收取10元|
|28天期|0.02%|每10万元28天收取20元|
|91天期及以上|0.03%|每10万元91天或更长期限收取30元|

手续费的计算方式为：手续费 = 交易金额 × 手续费率 × 天数。例如，使用5万元进行3天期国债逆回购，手续费为5万 × 0.003% × 3天 = 4.5元。

需要注意的是，以上是标准手续费，绝大部分证券公司在手续费方面存在协商空间，部分券商会提供手续费折扣，如五折、三折甚至一折，投资者可通过与券商协商获得更低的手续费率。

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