在理财通和支付宝买基金，整体而言支付宝的费用更低。

申购费
申购费率方面，支付宝优势明显。主流基金在支付宝普遍享受1折优惠，即0.15%的申购费率。以10万元投资为例，支付宝仅需150元手续费。而微信理财通部分基金申购费率仍维持0.6%，若买10万元基金，需600元手续费，是支付宝的4倍。虽然微信部分促销基金也能降至0.15%，但覆盖范围较窄。不过，微信理财通的基金申购在某些情况下对小额投资者是免费的，例如申购金额在十万以下时，便可以享受到这种优惠。

赎回费
持有不足7天，二者都收取1.5%的惩罚性费率。但对于长期持有债券基金等产品，支付宝的赎回费率更优惠，如持有30天至365天，赎回费率降至0.1%，而微信部分债券基金赎回费可能维持0.5%。货币基金方面，两者均免申赎费。

其他费用
微信若用零钱买基金，提现超1000元部分需额外付0.1%手续费，支付宝无此费用。

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