选择券商办理国债逆回购开户时，可以从以下几个角度综合比较：

佣金费率：不同券商对国债逆回购的佣金收取标准并不统一。建议选择费率较低或可议价空间大的券商，尤其是一些通过线上渠道开户的新客户，往往能获得更低的优惠费率。

交易系统与平台稳定性：逆回购资金通常在特定时间段集中操作，系统稳定性很关键。应选择APP端、PC端交易系统运行稳定、下单执行迅速的券商，以避免高峰期交易卡顿或延迟。

客户服务与操作指导：券商是否提供快速响应的客服支持、完善的新手指南、以及国债逆回购的操作演示与教学，也是重要考量。部分券商配有专属客户经理，可以提供个性化服务。

交易功能与体验：优先选择交易功能完善的券商，比如支持到期自动提醒、余钱理财、自动逆回购等智能功能，能提升资金使用效率。

综合口碑与品牌实力：大型或专业化程度较高的券商在安全性、系统维护和产品丰富度上通常更有保障。例如银河证券、华泰证券、国金证券、中信证券等，在费率、平台性能和服务满意度方面普遍表现较好。

简要建议：
如果以低成本为首要目标，重点比较佣金费率；如果更关注交易便捷性和安全性，可优先选择系统稳定、服务完善的中大型券商。整体而言，线上开户流程简单快捷，可以多咨询几家券商的费率和服务后再作决定。