100 万元股票买卖的手续费由佣金、过户费、印花税三部分组成，其中佣金费率可协商，过户费仅沪市收取，印花税仅卖出时收取，具体计算如下：
1.佣金
这是券商收取的费用，也是唯一可协商的部分，目前市场默认费率多为万分之三，100 万元资金可协商至万分之一左右，且买卖双向收取，100 万的交易额远高于 5 元最低佣金门槛，按实际金额计算。
万分之三费率：买入和卖出佣金各为 1000000×0.03%=300 元，合计 600 元；
万分之一费率：买入和卖出佣金各为 1000000×0.01%=100 元，合计 200 元。
2.过户费
由中国登记结算所收取，费率固定为成交金额的万分之 0.1，双向收取，深市股票免收该费用。100 万元买卖沪市股票的过户费为买入 1 元 + 卖出 1 元，合计 2 元；深市股票过户费为 0 元。
3.印花税
属于国家税收，仅卖出时收取，当前费率为成交金额的万分之五。100 万元卖出时需缴纳的印花税为 1000000×0.05%=500 元，买入时无需缴纳。