您好，支付宝目前与多家头部及区域性证券公司合作，如中信证券、华泰证券、国泰君安、广发证券、中信建投、银河证券、国金证券、东方证券、国泰海通证券、安信证券、国信证券、海通证券等。通过支付宝开户的默认佣金通常为万分之三（0.03%），但可以通过联系对应券商的客户经理协商申请更低的费率。

手续费（佣金）：

1、默认费率： 通过支付宝开户时，默认的佣金费率通常为万分之三 (0.03%) 左右，也有信息提及万分之2.5 (0.025%)。这个费率是行业常规水平。

2、最低收费： 一般情况下，单笔交易佣金低于5元时，会按5元收取。

3、低佣申请： 虽然支付宝默认佣金是万3左右，但想要获得更低佣金，需要联系对应券商的线上客户经理进行协商。客户经理可以根据您的资金量、交易习惯等因素，为您申请更优惠的费率。

4、通过正规渠道开户：可以关注公众号“3句话财道”，输入“低佣开户”，能获取优惠入口。

以上是我对支付宝合作的证券公司是哪几家？手续费在多少？的专业解答，如果想要低佣金账户，可以关注公众号“3句话财道”，输入“低佣开户”，能获取优惠入口。