选择不同证券公司时，佣金确实是一个重要的区别，但还有其他因素需要考虑：

佣金费率：不同证券公司提供的佣金费率可能有所不同。虽然大多数券商的默认佣金在万分之三左右，但有些券商会对新客户提供更优惠的费率，或者允许高频交易者协商更低的佣金。

服务内容：大型券商通常提供更全面的服务，包括专业的投资顾问团队和资产配置建议等增值服务。而一些中小券商可能更注重线上服务的便捷性和快速响应。

交易功能：不同券商提供的交易平台功能可能存在差异。一些券商支持量化交易工具和特色账户功能，适合高频或程序化交易者，而普通投资者可能更关注交易平台的流畅度和资讯更新速度。

线下服务：如果你需要线下办理业务，大型券商通常有更多的线下网点。而纯线上券商则更适合习惯于通过手机进行操作的投资者。

因此，选择证券公司时，应综合考虑佣金费率、服务内容、交易功能和线下服务等多个方面，以便找到最适合自己需求的券商。