逆回购交易手续费通常由券商统一制定，不论是通过券商APP还是第三方交易软件进行操作，手续费标准应当是一致的。之所以会有客户感觉在不同渠道存在差异，可能是由于以下原因：

1. 显示方式不同：不同交易软件在展示费率时可能存在展示方式的差异，可能导致客户产生误解。
2. 优惠活动：券商可能在特定渠道推出暂时性的优惠活动，但这通常会明确告知客户。
3. 系统问题：极少数情况下，由于系统故障或设置错误，可能会导致某一时段内手续费计算出现偏差。

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