在手机上申请证券公司低交易费的证券账户，可以按照以下步骤进行：

准备材料：确保你有有效期内的身份证和一张常用的一类银行卡。保持手机网络稳定。

联系客户经理：通过财经论坛、社交媒体或券商的官方网站找到客户经理，表明你希望申请低佣金账户，并确认佣金费率类型为“全佣”（包括所有费用，无隐性成本）。获取客户经理的专属开户链接或二维码。

下载券商APP并开户：使用客户经理提供的专属链接下载券商的官方APP。按照APP内的指引，进行手机号注册、上传身份证信息和填写个人信息。完成风险测评问卷，并进行视频认证以确认身份。

绑定银行卡：在APP内绑定你的银行卡，设置交易密码，并仔细阅读和签署电子协议。

提交申请：确认所有信息无误后，提交开户申请。一般情况下，审核通过后会收到通知。

确认费率：开户成功后，立即与客户经理确认佣金费率已调整至你们约定的标准。你可以通过交易软件查看交割单来核实实际费率。

通过以上步骤，你就可以在手机上成功申请一个低交易费的证券账户。