线上注册证券公司低手续费账户的操作步骤如下：

选择券商：选择知名度高、服务好的券商，例如华泰证券、国泰君安等。可以通过券商的官方网站、官方APP或者知名理财平台找到“低佣开户”的入口。

联系客户经理：通过券商的在线客服、微信公众号或者熟人推荐，找到合适的客户经理。与客户经理沟通，表明希望获得低佣金账户，并了解具体的费率和优惠条件。

准备材料：确保准备好开户所需的材料，包括个人身份证（正反面）、一类银行卡（建议使用常见的大行银行卡）和本人实名的手机号码。

在线开户：通过客户经理提供的专属链接，按照指引进行线上开户。过程中需要上传身份证照片、进行视频验证（确保环境安静且光线充足）、完成风险测评问卷，并绑定银行卡。

耐心等待审核：提交开户申请后，通常需要等待1到2个工作日进行审核。期间可以保持联系，了解审核进展。

确认佣金率：开户成功后，登录账户查看具体的佣金设置。如有疑问或发现与预期不符，及时与客户经理沟通确认。

通过以上步骤，可以顺利开设一个低手续费的证券账户。