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5万资金券商开户佣金协商降低方法如下：

1.联系客户经理协商：主动联系券商的客户经理，表达降低佣金的意愿，并询问是否有相关优惠政策。客户经理通常具有一定的佣金优惠权限，可以根据账户的资金量、交易频率等因素，在符合公司政策的前提下，给予一定的佣金优惠。

2.增加交易频率：券商更倾向于为交易频繁的客户提供低佣金，因为高频交易能为券商带来更多手续费收入。若5万资金对应较高的交易频率，可增加协商空间。关注券商优惠活动：证券公司会定期推出开户优惠活动，特别是在新客户开户时。可以关注券商的官方网站、社交媒体平台或手机APP等渠道，及时获取相关信息并参与其中，以获取更低的佣金费率。

3.重新选择券商开户：如果当前券商无法满足降低佣金的要求，可以考虑将资金转到佣金更低的券商。在转户时，可以选择将资金直接转到新券商，或办理转户手续，而无需先卖出股票。

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