从申购赎回方面来看，ETF的申赎是股票和基金份额之间的交换，而LOF的申赎是现金和份额之间的交换。

两者的申赎时间也会有所差异：
股票ETF、债券ETF等实物申赎品种的申赎可即时确认，当天申购的份额可立即在二级市场上卖出，实现变相T+0交易；QDII-ETF、黄金ETF等全现金替代申赎品种的申购是当日确认，下一交易日可卖出或赎回。

而LOF的申购是T+1日确认，T+2日才可以卖出或赎回，速度显然不够ETF迅速。
ETF由于是股票申购份额，所以基本是满仓操作。
而LOF则需要保留一定比例的现金，以备投资者随时赎回，因此仓位不可能是满的，哪怕LOF基金中也会有指数基金，但跟踪指数的效率，绝对没有跟踪相同指数的ETF高。

ETF在每日申赎清单中都会充分披露其组合情况，LOF只会在季末才披露一次。
ETF每15秒提供一次基金参考净值，LOF要到每个交易日结束后（通常是晚间）才公布当天的收盘净值。

在牛市行情中，由于整个市场全面走强，场外资金也纷纷入市投资。在这样的情况下，LOF基金就会因为不断有资金进行申购，而把原来持有LOF基金份额的投资者的收益不断摊薄。不仅如此，还会使得指数型LOF对指数的跟踪能力有所减弱。

但ETF不会出现这样的情况，因为ETF的申购是用股票来换取份额的，ETF规模的扩大，意味着整体收益都会增加，不会造成新加入的投资者对老的持有者利益的侵占，这样就会非常公平。